新生儿、婴幼儿先天性肾积水一般都是胚胎时期，先天性因素导致的肾盂输尿管交界处发生狭窄，肾脏产生的尿液经肾盏到肾盂，从肾盂往下流的过程中受阻，把肾盂憋大。在怀孕过程中，孕早期产科随诊时，拿B超一照就会告诉孕妇孩子肾盂扩张，这是先天性的，肾盂输尿管交界处狭窄所引起来的肾积水。肾积水除了肾盂肾管交界处以外还有其他的，比如输尿管狭窄最多见的息肉，也是先天性的，是输尿管长息肉，尿液过不去、把上面憋起来了。另外，膀胱输尿管交界处狭窄引起来的肾积水，或者膀胱输尿管交界处反流引起的肾积水，是由于膀胱和肾小管交界处出问题，狭窄尿下不来，反流膀胱的尿液，向上又回到肾盂、肾脏，把肾盂扩大。再往下就是后尿道，如果后尿道有瓣膜，撒尿撒不出去时，高压情况下尿经过输尿管、肾脏往上面走，双侧肾盂输尿管反流、肾积水。总结一下，任何在尿液下排的过程中导致排尿不畅，长时间以后都会引起肾盂积水，也就是临床上的肾积水。
