大脑炎后遗症有可能无法治好，只要是神经系统后遗症，代表疾病经过一段时间治疗及康复后，再也不能恢复。任何后遗症都有一段时间的观察期，比如有器质性脑损伤疾病，出现神经功能缺失性症状，大概需要观察1年。1年内能够恢复好转便可临床诊断痊愈，若超过1年神经功能缺损性症状无法恢复，则叫做后遗症，意味着会终身遗留，无法治好。
大脑炎是脑细胞遭到微生物侵袭导致，会产生癫痫、认知功能损伤，也可导致各种感觉、运动、语言功能下降。如果存在后遗症，可能会终生存在不可治愈的症状。
